La situación es diferente en su etapa como entrenador, la cual decidió comenzar ese mismo año que se retiró como jugador.
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Gatusso actualmente dirige al AC Pisa, club de la segunda división del fútbol de Italia y para mala fortuna ha perdido la categoría. Ahora pasarán a la tercera división.
El equipo de Gattuso ocupa la penúltima posición ya que en 40 partidos disputados hasta la fecha, el conjunto italiano ha sumado seis victorias, 20 empates y 14 derrotas.
Suma 34 puntos (fue sancionado con cuatro por una decisión federativa). Hasta hace poco era colista, pero ese puesto ha pasado a ser para el Latina por otra sanción de siete puntos.
Lo curioso del equipo de Gattuso es el número de goles en sus partidos. Ha descendido de categoría siendo el equipo menos goleado de toda la Serie B, con un total de 33 en 40 partidos. El siguiente en la lista sería el Spezia, que ha recibido 34 y ocupa la octava posición, que da acceso para acceder a playoff por subir a Serie A.