El equipo emplumado barre las series de semifinales y finales ante el equipo merengue, aunque hay una instancia de muerte súbita en la hexagonal del 2000-2001 que se la llevó Olimpia, la única que le gana al Motagua.
SERIES DE INSTANCIAS FINALES ENTRE MOTAGUA Y OLIMPIA
Muerte Súbita (Hexagonal)
Clausura 2000-2001
Motagua 1-2 Olimpia
Olimpia 1-1 Motagua
*Olimpia avanzó a semifinales en la única instancia que le gana la serie a Motagua
EN SEMIFINALES
Apertura 1997-1998:
Olimpia 1-2 Motagua
Motagua 0-1 Olimpia
*Motagua avanzó a la final por mejor posición en la tabla
Apertura 2001-2002
Olimpia 1-0 Motagua
Motagua 4-2 Olimpia
*Motagua avanzó a la final en el global
Clausura 2001-2002
Motagua 2-2 Olimpia
Olimpia 0-2 Motagua
*Motagua avanzó a la final
Clausura 2005-2006
Motagua 2-1 Olimpia
Olimpia 2-1 Motagua
*Olimpia avanzó a la final por mejor posición en la tabla
Clausura 2007-2008
Motagua 1-4 Olimpia
Olimpia 3-1 Motagua
*Olimpia avanzó a la final
Apertura 2009-2010
Olimpia 0-1 Motagua
Motagua 0-2 Olimpia
*Olimpia avanzó a la final
Apertura 2014-2015
Motagua 1-0 Olimpia
Olimpia 1-1 Motagua
*Motagua avanzó a la final
Apertura 2015-2016
Olimpia 1-1 Motagua
Motagua 1-1 Olimpia
*Motagua avanzó a la final por mejor posición en la tabla
Clausura 2015-2016
Motagua 0-0 Olimpia
Olimpia 2-0 Motagua
*Olimpia avanzó a la final
Apertura 2016-2017
Motagua 1-0 Olimpia
Olimpia 1-1 Motagua
*Motagua avanzó a la final
Apertura 2017-2018
Olimpia 2-0 Motagua
Motagua 3-1 Olimpia
*Motagua avanzó a la final por mejor posición en la tabla
Clausura 2017-2018
Olimpia 0-0 Motagua
Motagua 1-1 Olimpia
*Motagua avanzó a la final por mejor posición en la tabla
Resumen: 12 semifinales: Motagua ganó 8 y Olimpia ganó 4.
EN FINALES
Clausura 1997-1998
Motagua 0-0 Olimpia
Olimpia 0-1 Motagua
*Motagua campeón (gol de oro).
Apertura 1999-2000
Olimpia 0-0 Motagua
Motagua 0-0 Olimpia
*Motagua campeón (penales)
Clausura 1999-2000
Motagua 1-1 Olimpia
Olimpia 1-1 Motagua
*Motagua campeón (penales)
Apertura 2006-2007
Motagua 1-1 Olimpia
Olimpia 1-3 Motagua
*Motagua campeón
Clausura 2009-2010
Olimpia 3-1 Motagua
Motagua 1-0 Olimpia
*Olimpia campeón.
Clausura 2010-2011
Motagua 2-2 Olimpia
Olimpia 1-3 Motagua
*Motagua campeón
Clausura 2014-2015
Motagua 1-2 Olimpia
Olimpia 0-0 Motagua
*Olimpia campeón
Apertura 2018-2019
Olimpia 0-2 Motagua
Motagua 0-1 Olimpia
*Motagua campeón
Clausura 2018-2019
Motagua 2-2 Olimpia
Olimpia 0-1 Motagua
*Motagua campeón
Resumen: 9 finales: Motagua ganó 7 y Olimpia ganó 2.