Leer más: Frank Fabra se pierde el Mundial con Colombia por lesión
El equipo de la ciudad de Ibagué (centro), dirigido por Alberto Gamero, venció 2-1 en los 90 minutos a los verdolagas con un tanto de Sebastián Villa (47) y un gol agónico de Danovis Banguero (93).
Los del argentino Jorge Almirón descontaron con un cabezazo de Vladimir Hernández (65).
Nacional había vencido 1-0 en el duelo de ida, disputado el miércoles en Ibagué, por lo que el 2-1 obligó a la definición desde los once pasos.
La gran figura en los penales fue el arquero de los vinotintos, Álvaro Montero, quien atajó los disparos de Reylando Lenis y de Hernández.
Los 'pijaos' habían alcanzado su única estrella en 2003.
Nacional, por su parte, se mantiene como el equipo más laureado de Colombia, con 16 títulos de liga en su haber.
SÉPALO
Hace aproximadamente un año, el delantero hondureño Eddie Hernández fue integrante de este modesto club, mismo con el que no triunfó y alcanzó nada más a jugar un par de minutos.