En el año 2000, la Selección Nacional fue relegada por diferencia de goles al segundo lugar de la triangular que disputó ante Panamá y Nicaragua y en esa condición tuvo que enfrentar a Haití en la búsqueda de un boleto a la segunda ronda eliminatoria.
En esa etapa enfrentó a Jamaica, El Salvador y San Vicente. En el primer duelo, el equipo catracho se impuso por 4-0 en San Pedro Sula y culminó la obra con un triunfo por 1-3 en el estadio Silvio Cator en Puerto Príncipe.
Tres años más tarde, Honduras se ubicó en el cuarto lugar del VII Torneo Uncaf, disputado en Panamá, ello tras ganar un sorteo mediante el lanzamiento de una moneda luego de igualar con la escuadra anfitriona tras igualar en puntos, goles a favor y en contra, además de haber empatado 1-1 en su enfrentamiento directo.
Con eso, el conjunto bicolor debía enfrentar en Martinica a Trinidad Tobago y al representativo local para obtener uno de los dos boletos disponibles para la Copa Oro.
En el primer duelo, Honduras venció 2-0 a los 'Soca Warriors', resultado que le permitía asegurar su participación en la justa regional ya que en el primer juego de la serie, los trinitarios habían caído 3-2 frente a los anfitriones.
Finalmente, el equipo dirigido por Edwin Pavón se hizo con el primer puesto de la serie al superar por 4-2 a Martinica con goles de Wilmer Neal Velásquez, Walter Castro Hernández, Francisco Ramírez y Danilo Turcios.
