Las dos erupciones duraron unos siete minutos, según el organismo.
Las autoridades locales ordenaron a los residentes permanecer fuera de un área de tres kilómetros alrededor del cráter, situado cerca de Yogyakarta, la capital cultural de Indonesia.
La agencia no aumentó el nivel de alerta del volcán tras las explosiones, pero pidió cautela a las compañías aéreas que sobrevuelen la zona.
La prensa local informó que los vecinos de localidades cercanas, como Sleman y Klaten, oyeron un gran estruendo por la mañana.
En 2010, una erupción del Merapi provocó la muerte de más de 300 personas y obligó a evacuar a 280.000 habitantes.
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Fue la erupción más potente desde la de 1930 que causó unos 1.300 muertos. Otra explosión en 1994 dejó 60 víctimas.
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Este archipiélago del sudeste asiático cuenta con más de 17.000 islas e islotes y cerca de 130 volcanes activos.
Indonesia se encuentra en el cinturón de fuego del Pacífico, donde la fricción de las placas tectónicas provoca frecuentes terremotos y erupciones volcánicas.
