El ex DT de la selección de Honduras informó su decisión a través de la red social de Twitter donde agradeció el apoyo durante el tiempo que estuvo al frente del club de Bogotá.
'Quiero informar a la opinión pública, a la hinchada de Millonarios y a los medios de comunicación que he presentado a la Junta Directiva de Millonarios FC mi renuncia como Director técnico del equipo. Mi aprecio y admiración siempre por esta gran institución'.
Pinto se va en el Torneo Apertura 2019 después de haber dirigido 20 partidos y dejar a su equipo en la posición 11 con 28 puntos y fuera de puestos de clasificación y torneos sudamericanos.
Pinto se va de este equipo casi un año después de haber tomado el cargo, pues fue nombrado como en 13 de noviembre de 2018 y a pocos días de cumplir los 12 meses, ha dejado el cargo.
Este era el tercer período de Pinto en la institución ya que los había dirigido en la temporada 84-85 1998-99.

En esta tercera etapa, Pinto dirigió 46 partidos de Liga, con saldo de 22 victorias, 12 empates y 12 derrotas, con 61 goles anotados y 47 recibidos, para un rendimiento del 55 por ciento.
Este era el primer empleo de Jorge Luis después del rotundo fracaso con la selección de Honduras al no clasificarla al Mundial de Rusia 2018 y quedar eliminada en el repechaje contra Australia.